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研究方向¶
- 宏基因组
- 蛋白质组学
- 微生物多组学
- 病原微生物与宿主互作
- 噬菌体与肠道稳态
开始之前¶
微生物与测序技术¶
微生物是世界上种类最多、最复杂的生物。微生物的代谢和动物、植物、人类健康、土壤大气、海洋环境都息息相关。微生物组学的研究,需要多学科交叉,多领域合作。
高通量测序技术已经发展了很多年,广受欢迎的小型测序仪MiSeq和PGM已经经历住市场的考验。同时新的技术和仪器的出现仍在不停推动测序技术领域的应用,如PacBio旗下测序仪对长片段测序的应用;Nanopore MinIon测序仪在许多传染病疫情的现场实时测序应用;中国CDC在国内部分省级CDC开展的华大自主测序仪的应用,宏基因组技术也在SRAS2的鉴定中起到了重要的作用。
高通量、便携式测序仪的出现,降低了测序的成本,大量基于测序的微生物组学研究工作得以开展。测序数据的不断产出,需要生物信息学人才来参与到测序数据的分析以便获得有价值的生物学信息对于许多小型实验室来说,很难招募到优秀的生物信息学人才。对于非专业背景的人来说,命令行以及软件的安装可能是学习中遇到的首要难题。
本网站主要用于分享一些常用的Linux命令和NGS软件,通过微生物组学、多组学的研究案例,帮助原来从事湿实验领域的同学能较好的了解和掌握高通量测序数据分析,将学习曲线变得平缓。同时也希望能对从事该领域的其他工作者提供便利,让大家在需要分析微生物基因组数据时,能有一个资料与实例汇集的手册可以快速参考和学习。
关于我们¶
一群来自世界各地、有梦想的bioer