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HYX's Bioinformatics

04. sourmash

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数据分析笔记
数据分析笔记
- 第零章开始之前
- 第一章常用工具
  第一章常用工具
- 第二章组装与比对
  第二章组装与比对
- 第三章基因组注释
  第三章基因组注释
- 第四章基因组比较
  第四章基因组比较
- 第五章泛基因组分析
  第五章泛基因组分析
- 第六章基因组可视化
  第六章基因组可视化
- 第七章综合分析平台
  第七章综合分析平台
- 第八章重组与种群分析
  第八章重组与种群分析
- 第九章细菌扫描工具
  第九章细菌扫描工具
- 第十章宏基因组分析
  第十章宏基因组分析
  - 01. kraken
  - 02. centrifuge
  - 03. bracken
  - 04. sourmash 04. sourmash
    Table of contents
    
    安装
    
    使用
  - 05. clark
  - 06. krona
  - 07. pavian
  - 08. supri
  - 09. shotgun 分析
  - 10. 16S 种群分析
  - 11. KmerFinder
  - 12. Meta-BEETL
- 第十一章单分子测序
  第十一章单分子测序
- 第十二章多重序列比对
  第十二章多重序列比对
  - 01. 多重序列比对
- 第十三章进化树构建分析
  第十三章进化树构建分析
- 第十七章分子地理流行病学
  第十七章分子地理流行病学
  - 04. CartoDB
  - 05. leaflet
- 第十八章分析实践
  第十八章分析实践
  - 01. 细菌SNP溯源分析一
  - 02. 细菌比较基因组学研究
- 第十九章工具流工具
  第十九章工具流工具
  - 05. workflow工具软件
- 第二十章其他
  第二十章其他
  - 02. GI转Accession
专项教程
专项教程
- Linux入门
  Linux入门
- 常用编程语言
  常用编程语言
- 数据文件格式
  数据文件格式
  - 01. fasta
  - 02. embl
  - 03. fastq
  - 04. gcg
  - 05. sam
  - 06. bam
  - 07. bed
  - 08. vcf
  - 09. gff
  - 10. cram
博文日志
博文日志
生信笔记
生信笔记
关于我们
关于我们

sourmash¶

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内容简介

安装¶

使用¶